Existe limite de usuários?

Não. O preço é por loja, sem licença por usuário.

Que tipos de usuário existem?

Administrador, Gerente e Usuário. Só o administrador cria e gerencia usuários, e ele pode liberar permissões avulsas, como receber de clientes ou ver relatórios financeiros.

O que acontece com um usuário sem nenhuma loja liberada?

Ele não vê nada: as listas voltam vazias, ele não consegue abrir caixa nem registrar venda e as alterações são recusadas.

Um funcionário com duas lojas vê as duas ao mesmo tempo?

Ele escolhe a loja atual no topo da tela, entre as dele. Vendas e caixa ficam presos à loja atual. O estoque, os envios e as transferências usam todas as lojas liberadas para ele.

O funcionário da loja vê as contas a receber da empresa?

Só se tiver a permissão de relatórios financeiros, que vem com o administrador e o gerente. Quando vê, é da empresa inteira, não só da loja.

Como dar acesso a cada funcionário só da loja dele?

Resposta curta: use um sistema em que cada usuário seja ligado a uma ou mais lojas, e em que o sistema, e não só o menu, esconda o que não é da loja dele. No NexaLoop, o administrador libera as lojas de cada usuário. Vendas, caixa, estoque e envios seguem as lojas liberadas, e quem não tem nenhuma loja não vê nada. Algumas coisas, como o cadastro de clientes e de produtos, são da empresa inteira. Serve para redes com duas lojas ou mais.

O que você precisa, use o sistema que for

Usuário ligado a uma ou mais lojas, e não só uma senha para todos.
Bloqueio de verdade, no sistema, e não apenas um menu escondido.
Perfis diferentes para dono, gerente e caixa.
Saber o que é da loja e o que é da empresa, como o cadastro de clientes.
Sem custo por usuário, para não limitar a equipe.

Como o NexaLoop resolve

Lojas por usuário. Ao criar ou editar um usuário, o administrador escolhe as lojas dele. Um usuário que não é administrador e fica sem lojas informadas recebe a loja de vendas padrão.
Perfis. Administrador, Gerente e Usuário (o caixa). O administrador vê todas as lojas e gerencia os usuários. Ele também pode liberar permissões avulsas a uma pessoa, como receber de clientes, ver relatórios financeiros ou liberar vendas acima do limite de crédito.
Loja atual. Quem tem mais de uma loja escolhe a atual no topo da tela, só entre as dele. Quem tem uma só nunca vê essa escolha.
O que segue a loja. Vendas, pedidos, turnos de caixa, saldo do caixa, estoque, envios e transferências, o painel inicial, os relatórios de caixa e de vendas, pedidos de compra, contas a pagar, links de pagamento e chaves de API.
O que é da empresa inteira. Clientes e o saldo que devem, o relatório de contas a receber, o fluxo de caixa, as contas financeiras, as formas de pagamento, o cadastro de produtos (inclusive a busca no caixa) e o cadastro de fornecedores.
Usuário sem loja. Não vê nada e não consegue vender nem alterar dados.
Sem licença por usuário. O preço é por loja.

Exemplo

Exemplo: uma rede com duas lojas. A funcionária do caixa da loja 1 recebe o perfil Usuário e só a loja 1. Ela abre o caixa e vende na loja 1, e não vê as vendas da loja 2. O gerente recebe as duas lojas e escolhe a loja atual no topo da tela. O dono, administrador, vê tudo.

O que isto não faz

Não separa os clientes por loja: o cadastro de clientes e o saldo que eles devem são da empresa.
Não filtra contas a receber por loja: o relatório é da empresa inteira, para quem tem a permissão.
Não deixa o funcionário de uma loja receber uma transferência para ela sem ter acesso também à loja de origem.
Não permite que o administrador conceda a outra pessoa a visão de todas as lojas: ela é do administrador.
Não limita a quantidade de usuários.